PCR實驗室并沒有嚴格的凈化要求，但是為避免各個實驗區域間交叉污染的可能性，宜采用全送全排的氣流組織形式。同時，要嚴格控制送、排風的比例以保證各實驗區的壓力要求。

　　1試劑貯存和準備區

　　PCR實驗室

　　該領域的主要操作是儲存試劑的制備、試劑的分離和主反應混合物的制備。試樣制備所用的試劑和材料應直接運往該區域，不得通過其他區域。試劑的原材料必須儲存在區域內，所需的儲存試劑必須準備在區域內。

　　這個區域對氣壓的控制沒有嚴格的要求。

　　2標本制備區

　　該區域發展主要問題進行的操作為中國臨床研究標本的保存、核酸（RNA、DNA）提取、貯存技術及其企業加入至擴增以及反應管和測定RNA時cDNA的合成。

　　PCR實驗室設計

　　該區域的氣壓梯度是相對于鄰近區域的正壓力，以避免氣溶膠污染從鄰近區域進入該區域。此外，應避免在該區域內作不必要的移動，因為在采樣過程中可能會發生氣溶膠污染。

　　3.反應混合物和擴增區的制備

　　該區域發展主要問題進行的操作為DNA或cDNA擴增。此外，已制備的DNA模板和合成的cDNA（來自不同樣本可以制備區）的加入和主反應體系混合液（來自其他試劑以及貯存和制備區）制備成反應形成混合液等也可在本區內企業進行。在巢式PCR測定中，通常在我們第壹輪經濟擴增后必須通過打開市場反應管，因此巢式擴增有較高的污染具有危險性，第二次加樣必須在本區內工作進行。

　　本區的壓力以及梯度發展要求為：相對于其他鄰近國家區域為負壓，以避免由于氣溶膠從本區漏出。為避免產生氣溶膠影響所致的污染，應盡量可以減少在本區內的不必要的走動。個別操作如加樣等應在超凈臺內進行。

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